DNAメチル化由来のProtein EpiScoresが結腸直腸がん（CRC）患者の生存予測を改善する可能性
Protein EpiScoresとは
DNAメチル化プロファイルから導き出されるバイオマーカーであるProtein EpiScoresは、従来の臨床リスク因子のみと比較して、結腸直腸がん（CRC）患者の無病生存期間および全生存期間の予測精度を向上させる可能性があることが、前向き研究の結果から示唆されました。
これまでの研究では、CRCのリスクマーカーとしてエピジェネティッククロック（DNAメチル化プロファイル由来）が評価されてきましたが、これらは癌進行の特定の生物学的ドライバーを特定できませんでした。Protein EpiScoresは、循環タンパク質（例：C反応性タンパク質）や生理学的特徴（例：喫煙状況）に基づいて疾患予測を改善するDNAメチル化プロファイルに関する以前の研究に基づいて開発され、このギャップを埋める可能性があります。研究者らは、Protein EpiScoresが「直接測定値に対する補完的なクラスのバイオマーカー」となり得ると述べています。
研究の方法
この研究では、新たに診断されたCRC患者136人（ColoCare Study参加者）を対象としました。各患者について、治療前の全血サンプルから107種類のProtein EpiScoresが記録されました。無病生存期間と全生存期間は、中央値7.3年間、最長13.8年間追跡されました。追跡期間中に患者の26%が疾患再発を経験し、35%が死亡しました。研究者らは、これらのデータを用いて、Protein EpiScoresと従来の臨床リスク因子（腫瘍病期、診断時の年齢、性別、BMI、人種、腫瘍位置など）の予測力を比較しました。
主要な知見
標準的な臨床リスク因子に特定のProtein EpiScoresを追加することで、生存予測精度が有意に向上しました。
交絡因子で調整後、HCII、VEGFA、CCL17、LGALS3BPのProtein EpiScoresはそれぞれ、無病生存期間の悪化と独立して関連しており、ハザード比（HR）は1.62から1.71の範囲でした。これらのスコアを臨床モデルに追加することで、コンコーダンスインデックス（C-index）は0.64から0.70に改善しました。
LGALS3BPのProtein EpiScoreは、全生存期間とも独立して関連しており、ハザード比は1.80でした。このスコアをモデルに追加することで、C-indexは0.70から0.75に上昇しました。
- 最終的に、HCII、LGALS3BP、MMP12、VEGFAのProtein EpiScoresは、ハザード比が1.50を超え、無病生存期間と全生存期間の両方に関連していました。
臨床的意義と今後の展望
予測精度の向上は「控えめだが潜在的に有意義」であり、他の確立されたバイオマーカーからの改善に匹敵するとされています。再発予測のC-indexが0.64から0.70に改善したことで、患者の34%がより正確なリスクカテゴリーに再分類されました。これは、高リスク患者の治療不足や低リスク患者の過剰治療を防ぐ上で意味のある臨床的影響をもたらす可能性があります。
しかしながら、Protein EpiScoresの臨床使用にはさらなる検証が必要であり、現実的には「臨床導入までには数年かかる」と研究者は述べています。現在の知見は、免疫抑制や凝固などの生物学的経路がCRC患者の予後不良のドライバーである可能性を強調し、将来的な治療標的の特定に役立つ研究ツールとしての価値が高いとされています。
今後の研究では、より大規模で多様な患者集団（現在のコホートは93%が白人であったため）でのProtein EpiScoresの評価が必要とされています。
元記事：Adding Protein EpiScores May Better Predict CRC Survival